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象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展

科技工作者之家 05月12日

  象腿蕉(Ensete glaucum)是芭蕉科中耐寒的蕉类植物,原产于中国云南和东南亚地区,具有观赏、饲用和药用价值。中国科学院华南植物园教授John Seymour Heslop Harrison带领的研究团队,采用单分子纳米孔、Illumina测序策略,结合染色体构像捕获技术,发表了首个象腿蕉染色体级别的基因组序列,长度为481.5 Mbp,完整性较高(BUSCO 98.3%),注释获得36,836个编码基因,重复序列约占基因组的55%。象腿蕉与芭蕉属(Musa)代表物种的比较基因组学研究显示,象腿蕉的长末端重复序列的组成及其插入时间,与芭蕉科其他物种均有差异,芭蕉属比象腿蕉属有更多Copia象腿蕉LTR插入时间峰值3.5-5 Mya)比芭蕉属物种峰值2 Mya)更古老;发现芭蕉科在911染色体基数进化过程中复杂多样的染色体重组事件。该成果为蕉类作物保育和改良提供重要的基因组资源。  

  相关研究成果以A chromosome-level reference genome of Ensete glaucum gives insight into diversity and chromosomal and repetitive sequence evolution in the Musaceae为题,发表在Gigascience上。研究工作得到华南植物园海外知名学者项目、国家自然科学基金、广东省基础与应用基础研究基金的支持。法国农业科学中心科研人员参与研究。 

  论文链接 


内容来源:中国科学院

来源:中国科学院

原文链接:http://www.cas.cn/syky/202205/t20220512_4834413.shtml

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基因组 染色体 研究 芭蕉

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